深圳清華大學研究院是深圳市政府和清華大學于1996年12月共建的、以企業化方式運做的正局級事業單位，雙方各占50%股份，實行理事會領導下的院長負責制。研究院一期占地面積1.6萬平米、建筑面積３.2萬平米，1999年8月落成使用。
研究院在實踐中創立了“四不象”理論。即：研究院既是大學又不完全象大學，文化不同；研究院既是科研機構又不象科研院所，內容不同；研究院既是企業不完全象企業，目標不同；研究院既是事業單位又不完全象事業單位，機制不同。
在“四不象”理論和“創新、高效、務實、包容”八字院訓的指導下，研究院定位于充當清華大學推進區域科技經濟發展的典范、珠江三角洲高科技上市公司的搖籃和華南地區人才培養的重要基地。并據此提出了四個主要發展目標：第一，推出一大批擁有自主知識產權、面向市場的科技成果；第二，加速科技成果的轉化；第三，培育高科技創業企業；第四，培養高層次人才。
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