前提在于，你就職的公司規模。
普遍來說，一般的，規模越大越成熟的公司越注意工作流程的規范化和標準化，這種公司行政部門普遍比較強勢，當然對于剛起步的公司，更看重掙錢，行政部門就相對比較弱勢。
這不是絕對的，而是和公司決策層有直接關系。

至于你提到的問題，我的建議是這樣。
第一，做好調研。拿事實說話，拿數據說話，空口白牙的話畢竟不具備足夠的說服力。
第二，在調研的基礎上，找出解決問題的辦法。這是為下一步做的準備，簡單說，不能把問題踢給領導，要幫助領導出謀劃策。
最后，取得領導的百分之百支持，做好前兩點，認真地和決策領導細談，我看你職務是行政主管，應該可以直接和一把手對話，拿出書面報告和可行性建議，分析過程中可能出現的風險，向領導提出需要領導在哪方面予以支持，即便領導出于其他考慮，沒有采納你的建議，但至少他心目中不會否定你的工作。

如果上述過程順利，最難的一點來了，就是堅決貫徹落實。話說的有點官話，但做起來很難，基本上就是跟主要領導形成默契，你和他一個唱紅臉一個唱白臉，很多時候人緣不是靠老好先生來的，而是靠敬業和認真。

當然，一切都有前提，個人利益服從集體利益，就我感受，這是做行政工作每個人必須堅持的職業操守。